Состав
   - предмет, включающий в себя множество частей (элементов, компонентов), а также
   - описание качества, количества и иных характеристик частей такого предмета

Химический состав
Элементный (химический) состав – это перечень элементов, из которых сплав состоит.

Железнодорожный состав

Личный состав

слово состав обычно применительно к продуктам питания (ну так уж повелось)

===================================

Структура

   СТРУКТУРА есть взаиморасположение СОСТАВНЫХ ЧАСТЕЙ.

структура обычно бывает у системы.

Хотя можно сказать, что некоторые продукты при одинаковом составе имеют разную структуру.

структура трактуется как совокупность связей, существующих между составными частями объекта.
Причем эти связи являются устойчивыми и упорядоченными. Примером служит совокупность межатомных связей в молекуле.

структура является только внутренним аспектом любого феномена. Объект в целом нельзя назвать структурой.

===================================

Система

Система – это некий организованный объект, обладающий разнообразными свойствами и качествами.

Понятие «система» шире чем понятие "структура". Оно включает в себя все проявления какого-либо сложного объекта:
его значимые компоненты, связи между ними, особенности строения, функции и прочее.

Система приобретает свойства, которыми не обладают ее отдельные элементы.